臺灣之高溫氣候環境與長期集約耕作模式，加上農友對肥料使用種類及用量未有審慎考量，常導致土壤地力退化如土壤養分不均、生物多樣性降低、土壤酸化及鹽化 等，進而影響生產效能，此外為考量地球資源有限，未來施肥管理策略勢必需做調整，以達地力涵養、土壤環境改善及環境資源有效利用，於此微生物肥料將扮演絕 對性角色。舉例說明，農友慣用複合肥料做為作物營養需求之補充，導致土壤磷的累積，將造成環境問題與資源浪費。
因此於高磷含量之土壤，可應用溶磷菌將土壤中的固定性磷源，轉換為作物可吸收利用之型態，且可於作物需磷時期施用，例如根部旺盛生長及開花前施用，以動態調整土壤養分，有利於農業永續經營。
　  微生物肥料指其成分含具有活性微生物或休眠孢子，如細菌、放線菌、真菌、藻類及其代謝產物之特定製劑，應用於作物生產具有提供植物養分或促進養分利用等功效之物品。目前臺灣將微生物肥料列入肥料管理，並以微生物功能做為產品區隔，分別為:
(1) 豆科根瘤菌肥料(品目編號8-01)
(2) 游離固氮菌肥料(品目編號8-02)
(3) 溶磷菌肥料(品目編號8-03)   點擊查看陽田商品資訊
(4) 溶鉀菌肥料(品目編號8-04)
(5) 複合微生物肥料(品目編號8-05)
(6) 叢枝菌根菌肥料(品目編號8-06)
 

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