植物生長於土壤中，而1g土壤中就有微生物數億至數十億個，土壤越肥，土壤中微生物越多。土壤微生物的種類很多，特別是聚居在距綠色植物根系幾毫米範圍內的微生物群-根際微生物，與植物營養的關係最為密切。根際微生物存在於根圈中，根圈也稱根標，指生長中的植物根系直接影響的土壤區域，包括根系表面至幾毫米的土壤部位，為植物根系有效吸收養分的範圍，也是根系分泌作用旺盛的部位，因而是微生物和植物相互作用的介面。
植物在其生長過程中，既從外界吸收養料和水分，也向外界釋放各種無機和有機物質，根圈中有豐富的各類有機物質，如滲出物、分泌物、植物黏液、黏質、溶胞產物。植物具有明顯的根圈效應，離根越近，微生物數量越多。
有益影響:
1.改善植物營養：根圈微生物旺盛的代謝作用和所產生的酶類，加強了有機物質的分解，
促進了營養元素的轉化，提高了土壤中磷素與其他礦質養料的可給性。
2.根圈微生物分泌的維生素、氨基酸、生長刺激素等生長調節物質促進植物的生長。
3.根圈微生物分泌的抗菌素類物質，有利於作物避免土著性病原菌的侵染 。
4.產生鐵載體：鐵載體是微生物在缺鐵性脅迫條件下產生的一種特殊的、對微量三價鐵
離子具有 超強絡合力的有機化合物。
不利影響:
1.引起作物病害：由於某些寄主植物對病原菌的選擇性，致使一些病原菌在相應植物的
根圈大量生長繁殖，從而加重病害。
2.產生有毒物質：某些有害微生物雖無致病性，但它們產生的有毒物質能抑制種子的發
芽、 幼苗的生長和根系的發育。
3.競爭有限養分：植物和微生物的生長都需要養分，因此在根圈記憶體在的植物和微生
物之間的養分競爭作用，尤其是在養分不足時，矛盾尤為突出。再者，細菌對某些重
要元素的固定作用會嚴重影響植物吸收有效養分。
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